Poppy Playtime xoay quanh câu chuyện về một công ty sản xuất đồ chơi tên là Playtime Co., đã biến mất một cách bí ẩn. Người chơi vào vai một nhân viên cũ của công ty, quay trở lại để tìm hiểu nguyên nhân dẫn đến sự biến mất của công ty. Tuy nhiên, người chơi sớm phát hiện ra rằng công ty đã bị chiếm đóng bởi một cô gái búp bê tên là Poppy, người có khả năng điều khiển và thao túng mọi thứ.